More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4257 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4257  proline/glycine betaine transporter  100 
 
 		 230 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  53.04 
 
 		 432 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  51 
 
 		 466 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  51.49 
 
 		 453 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  52.17 
 
 		 439 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  51.74 
 
 		 439 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  51.69 
 
 		 448 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  45.22 
 
 		 437 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0959  major facilitator family protein  45.22 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1246  putative transporter  45.22 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  45.22 
 
 		 437 aa  204  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  45.22 
 
 		 437 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 437 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  43.42 
 
 		 437 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  46.29 
 
 		 445 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 441 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 441 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 439 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 441 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 441 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 441 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 431 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  42.6 
 
 		 440 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 433 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  43.81 
 
 		 430 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  42.79 
 
 		 434 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 430 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 430 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 417 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 430 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 430 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  44.55 
 
 		 430 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  44.09 
 
 		 430 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 437 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 434 aa  161  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 434 aa  161  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 443 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 435 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 438 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  40.6 
 
 		 445 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 443 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 443 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 443 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  42.27 
 
 		 435 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  42.27 
 
 		 435 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  42.73 
 
 		 435 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  40.6 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  40.6 
 
 		 445 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  40.6 
 
 		 445 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  40.6 
 
 		 445 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  42.73 
 
 		 435 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  40.6 
 
 		 445 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 443 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 440 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  42.73 
 
 		 435 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 443 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 447 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 438 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 440 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  40.64 
 
 		 435 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  40.64 
 
 		 440 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  41.63 
 
 		 430 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 430 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 438 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  38.91 
 
 		 438 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 438 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.79 
 
 		 430 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  37.44 
 
 		 434 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 438 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 438 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 438 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 438 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  39.23 
 
 		 473 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 443 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 433 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 428 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.39 
 
 		 435 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 443 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 426 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 426 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 426 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 437 aa  131  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1404  major facilitator family transporter  36.16 
 
 		 482 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1266  major facilitator family transporter  36.16 
 
 		 429 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1258  major facilitator family transporter  36.16 
 
 		 485 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0766  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 438 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  35.87 
 
 		 438 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1862  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 426 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 436 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 442 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1100  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 438 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0383  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 438 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 440 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 461 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 425 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>