225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0197 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  46.2 
 
 		 187 aa  170  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  44.81 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  47.28 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  44.57 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  43.26 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  42.39 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  44.02 
 
 		 187 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  42.86 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  42.93 
 
 		 188 aa  157  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  42.39 
 
 		 187 aa  154  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  40.86 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  35.48 
 
 		 209 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  46.45 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  42.86 
 
 		 193 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  45.45 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  39.78 
 
 		 182 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  37.36 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  40.21 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  42.25 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  41.3 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  41.85 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  41.12 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  38.64 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  39.57 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  39.79 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  38.17 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  35.48 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  39.13 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  34.88 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  38.92 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  38.5 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  37.91 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  37.84 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  35.05 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  38.42 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  40.64 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  33.52 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  33.51 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  34.24 
 
 		 201 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  36.31 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  33.7 
 
 		 213 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  34.48 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  32.79 
 
 		 201 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  32.99 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  32.11 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  32.46 
 
 		 237 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  34.07 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  31.79 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  32.24 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  31.52 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  35.12 
 
 		 184 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  34.13 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  33.88 
 
 		 198 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  35.12 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  35.06 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  33.53 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4106  protein of unknown function DUF179  36 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  33.92 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  30.77 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  31.52 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  31.61 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  31.76 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  29.78 
 
 		 200 aa  87.8  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  32.95 
 
 		 206 aa  87.8  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  30.29 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  32.26 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  34.3 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  33.16 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48166  predicted protein  33.33 
 
 		 393 aa  87  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  35.45 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  32.97 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  31.72 
 
 		 221 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  35.67 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  27.59 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  30.6 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  30.29 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  29.89 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4073  protein of unknown function DUF179  36 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.424244  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  32.43 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  31.43 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  29.51 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  31.18 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  30.94 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  31.82 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  30.81 
 
 		 216 aa  84.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  31.52 
 
 		 200 aa  84.3  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  30.9 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  29.51 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  30.98 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  33.69 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  33.69 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  33.16 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>