224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0140 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  64.52 
 
 		 186 aa  256  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  45.25 
 
 		 187 aa  168  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 182 aa  157  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  40.22 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  41.3 
 
 		 184 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  40.22 
 
 		 187 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  38.92 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  35.48 
 
 		 183 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  36.96 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  38.04 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  37.63 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  36.41 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  36.96 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  34.76 
 
 		 187 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  32.62 
 
 		 146 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  26.78 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  31.91 
 
 		 190 aa  92.8  4e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  27.66 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  34.01 
 
 		 187 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  34.01 
 
 		 187 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  34.01 
 
 		 187 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  24.64 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  32.89 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  32.89 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  32.89 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  32.89 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  27.53 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0426  hypothetical protein  26.09 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.152287  normal  0.709849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  32.65 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  24.73 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  25.79 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  27.92 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  32.65 
 
 		 185 aa  84.7  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  33.54 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  30.17 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  29.86 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  25.29 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  30.43 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  27.07 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  27.75 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  32.2 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  28.49 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  28.02 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  28.49 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  28.19 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  32.04 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  28.41 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  29.51 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  27.68 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  27.32 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  31.33 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  24.35 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  26.59 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  30.41 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  30.82 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  28.11 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  27.87 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  30.46 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  26.49 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  30.46 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  30.46 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  24.47 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  26.9 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  28.67 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  28.67 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  25.27 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  29.68 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  27.62 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  28.86 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  27.4 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  27.62 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  28.25 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  23.35 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  28.47 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  33.77 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  29.86 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  30.86 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  28.47 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  27.93 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  30.13 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  27.93 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  28.49 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  30.82 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  29.09 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  25.9 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  27.93 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>