221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1896 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  45.45 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  46.96 
 
 		 184 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  45.25 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  45.36 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  43.26 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  40.45 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  37.78 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  39.13 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  36.26 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  37.22 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  35.71 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  37.64 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  35.96 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  35.23 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  34.92 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  33.15 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  32.8 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  30.98 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  32.79 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  29.31 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  30.59 
 
 		 206 aa  91.3  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  31.35 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  31.25 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  30.98 
 
 		 190 aa  88.6  4e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  30.57 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  30.41 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  30.43 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  32.81 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  28.49 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  28.32 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  32.37 
 
 		 146 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  31.52 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  30.6 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  32.61 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  30.81 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  29.07 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  31.87 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  28.22 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  29.21 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  26.97 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  27.75 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  30.95 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  28.8 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  31.4 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  28.89 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  29.38 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  30.23 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  28.57 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  29.55 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  24.71 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  28.8 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  27.17 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  27.53 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  30.23 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  28.88 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  26.14 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  28.88 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1764  protein of unknown function DUF179  28.65 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.619647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  28.88 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  26.7 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  31.71 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  28.28 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  33.1 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  26.86 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  29.51 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  28.74 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  26.63 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  26.23 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  27.65 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  32.62 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0426  hypothetical protein  26.25 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.152287  normal  0.709849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  29.09 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  27.06 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  30.46 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  26.8 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  27.32 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  27.06 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  29.19 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  28.24 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  26.04 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  27.84 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  26.4 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  26.04 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  27.17 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  27.06 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  26.55 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  25.73 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  28.98 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>