220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5392 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  89.05 
 
 
201 aa  371  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  89.05 
 
 
202 aa  360  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  85.29 
 
 
204 aa  354  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  65.43 
 
 
225 aa  260  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  61.05 
 
 
209 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  55.85 
 
 
198 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  54.26 
 
 
193 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  52.15 
 
 
190 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  47.92 
 
 
193 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  45.45 
 
 
187 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  47.12 
 
 
192 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  44.92 
 
 
196 aa  154  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  45.36 
 
 
208 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  45.6 
 
 
196 aa  150  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  43.85 
 
 
196 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  48.09 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  44.2 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  43.32 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  43.3 
 
 
198 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  44.39 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  41.27 
 
 
192 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  44.57 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  38.67 
 
 
182 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  31.87 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  34.04 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  34.12 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  33.88 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  28.88 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  29.12 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  27.32 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  30.27 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  31.52 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  28.34 
 
 
188 aa  84.7  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  29.47 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  33.69 
 
 
183 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  29.35 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  32.09 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  27.57 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  27.89 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  28.88 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  26.83 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  28.57 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  30.39 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  29.17 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  29.37 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  29.37 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  30.07 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  31.11 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  32.57 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  28.98 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  28.57 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  26.74 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  28.41 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  27.06 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  29.83 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  31.58 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  28.26 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  29.89 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  29.7 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  30.36 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  29.7 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  28.8 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  29.7 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  29.7 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  29.7 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  29.09 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  28.8 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  29.7 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  30.13 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  29.7 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  31.9 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  30.29 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  29.7 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  28.74 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  30.13 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  30.13 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  32.89 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  28.14 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  30.13 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  29.51 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  30.61 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  30.95 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  26.77 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  31.45 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  27.87 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  29.17 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  30.13 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  30.13 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  28.07 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  30.53 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  30.13 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  25.81 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>