220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5395 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  54.21 
 
 		 198 aa  214  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  54.3 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  53.51 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  52.17 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  52.15 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  52.15 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  52.15 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  51.63 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  51.35 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  47.4 
 
 		 225 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  44.44 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  45.26 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  45.05 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  42.33 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  45.26 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  45.45 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  44.97 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  41.8 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  45.21 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  41.44 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  42.31 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  41.18 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  43.98 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  34.41 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  35.23 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  31.35 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  31.71 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  30.96 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  31.89 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  29.44 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  27.81 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  27.75 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  28.5 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  26.7 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  27.78 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  32.95 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  26.59 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  29.52 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  30.07 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  26.47 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  28.26 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  31.25 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1764  protein of unknown function DUF179  29.61 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.619647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  26.88 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  29.82 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  26.88 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  28.48 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  28.48 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  32.32 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  33.97 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  28.48 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  26.74 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  28.48 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  31.51 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  28.92 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  28.48 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  34.23 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  27.13 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  29.1 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  25.29 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  31.65 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  33.97 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  29.89 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  28.22 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  25.9 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  29.38 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  30.25 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  29.38 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  29.34 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  28.89 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  29.34 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  29.34 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  29.34 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  28.89 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  29.34 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  29.34 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  28.74 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  29.75 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  27.37 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  29.38 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  30.38 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  28.42 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  25.88 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  24.58 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  28.48 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  29.09 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  26.97 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  27.81 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  28.66 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  29.19 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  29.27 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  25.27 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  27.59 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  26.96 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>