222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1289 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  363  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  54.92 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  54.05 
 
 		 191 aa  175  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  53.44 
 
 		 198 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  50.79 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  51.81 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  51.87 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  52.43 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  49.72 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  50.8 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  46.11 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  46.03 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  46.28 
 
 		 196 aa  147  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  45.74 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  47.85 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  43.46 
 
 		 209 aa  140  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  44.57 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  45.11 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  46.63 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  42.93 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  46.03 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  41.85 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  41.85 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  38.92 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  39.13 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  34.24 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 182 aa  95.5  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  33.51 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  31.58 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  31.15 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  38.12 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  33.16 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  31.58 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  32.8 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  32.43 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  30.98 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  33.15 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  30.26 
 
 		 184 aa  85.9  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  32.35 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  36.81 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  35.33 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1764  protein of unknown function DUF179  29.67 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.619647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  35.93 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  24.08 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  31.9 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  31.87 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  34.13 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  32.93 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  30.97 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  33.53 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  30.67 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  26.99 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  30.11 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  30.11 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  30.11 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  33.92 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  29.73 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  30.11 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  26.18 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  32.93 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  32.03 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  32.32 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  30.67 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  32.32 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  26.9 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  32.32 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  29.76 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  27.75 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  28.33 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  28.33 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  30.54 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  28.14 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  30.49 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  28.98 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  28.98 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  29.89 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  25 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  34.21 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  30.18 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  30.07 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  31.76 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  28.14 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  28.14 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>