219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1471 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  54.79 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  57.07 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  54.21 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  53.65 
 
 		 198 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  49.23 
 
 		 192 aa  175  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  49.49 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  51.87 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  49.21 
 
 		 184 aa  161  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  48.65 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  48.11 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  48.09 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  48.09 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  48.09 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  45.99 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  47.28 
 
 		 187 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  45.99 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  48.39 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  46.99 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  44.81 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  44.62 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  47.85 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  40.59 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  44.58 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  37.43 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  40.64 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  43.98 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  32.28 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  34.39 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  31.03 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  34.43 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  32.8 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  34.76 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  32.61 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  33.5 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  35.98 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  31.69 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  35.08 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  30.81 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  33.5 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  34.09 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  31.28 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  31.02 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  29.83 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  29.83 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  29.83 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  31.38 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  30.6 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  29.44 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  29.05 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  27.37 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  29.95 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1764  protein of unknown function DUF179  29.63 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.619647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  29.95 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  35.39 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  32.45 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  28.93 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  30.39 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  29.41 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  30.11 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  29.02 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  27.92 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  33.52 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  32.2 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  28.81 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  29.26 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  23.76 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  30.99 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  29.83 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  29.83 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  28.87 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  29.83 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  29.83 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  31.84 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  27.22 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  30.32 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  28.49 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  33.78 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  30.81 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  25.68 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  28.8 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  28.8 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  28.8 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  30.05 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  28.72 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  29.83 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  28.27 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  29.81 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>