220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0426 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0426  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  344  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.152287  normal  0.709849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  34.62 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  34.07 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  38.67 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  38.67 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  38.67 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  39.05 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  39.11 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  38.55 
 
 		 190 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  35.75 
 
 		 198 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  38.12 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  35.2 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  37.77 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  37.77 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  37.28 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  38.71 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  32 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  37.87 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  38.25 
 
 		 190 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  38.46 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  36.7 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  36.46 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  36.46 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  36.46 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  37.57 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  32.45 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0057  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  36.09 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  32.64 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0062  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  36.57 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  34.29 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  32.63 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  36.96 
 
 		 197 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  37.93 
 
 		 193 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  33.51 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  35.36 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  36.76 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  34.57 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  32.98 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  28.99 
 
 		 197 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  33.9 
 
 		 192 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  36.11 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  34.08 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  32.45 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  33.52 
 
 		 190 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  36.41 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  31.93 
 
 		 203 aa  98.6  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  36.09 
 
 		 191 aa  98.6  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  33.52 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  38.55 
 
 		 214 aa  98.2  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  32.78 
 
 		 187 aa  97.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  32.78 
 
 		 211 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  32.78 
 
 		 211 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  32.78 
 
 		 187 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  32.78 
 
 		 187 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  35.93 
 
 		 184 aa  97.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  32.78 
 
 		 187 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  32.78 
 
 		 187 aa  97.4  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  32.78 
 
 		 187 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  32.78 
 
 		 187 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  36.46 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  37.65 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  35.12 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  36.46 
 
 		 192 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  31.61 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  36.46 
 
 		 192 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  37.65 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  35.29 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  35.39 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  32.98 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  35.83 
 
 		 207 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  36.31 
 
 		 201 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  35.12 
 
 		 189 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  33.52 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  34.46 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  35.12 
 
 		 189 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  35.83 
 
 		 192 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  35.2 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  31.72 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  31.72 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  35.93 
 
 		 188 aa  94.4  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  35.93 
 
 		 216 aa  94.4  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  31.72 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  31.72 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>