206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48166 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48166  predicted protein  100 
 
 		 393 aa  809    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118816  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  31.86 
 
 		 288 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  30.96 
 
 		 187 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  29.02 
 
 		 190 aa  87.4  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 		 183 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  32.76 
 
 		 187 aa  86.7  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  30.37 
 
 		 184 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  31.76 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  29.44 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  29.5 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  30.1 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  30.46 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  29.44 
 
 		 206 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  31.16 
 
 		 186 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  32.52 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  31.25 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  37.24 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  37.67 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  37.24 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  37.24 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  37.67 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  37.67 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  37.67 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  37.67 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  37.67 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  37.67 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  37.67 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  32.39 
 
 		 190 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  36.55 
 
 		 192 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  36.55 
 
 		 192 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  36.55 
 
 		 192 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  33.8 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  33.15 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  36.99 
 
 		 192 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  33.15 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  33.1 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  34.78 
 
 		 188 aa  67  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  30.52 
 
 		 184 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0457  hypothetical protein  35.44 
 
 		 199 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  29.14 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  27.81 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  26.47 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  29.94 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  28.87 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  28.81 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  28.77 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  27.57 
 
 		 198 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  29.17 
 
 		 197 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  32.03 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  28.24 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  28.24 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  29.61 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  29.61 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  31.69 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1377  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  26.44 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  28.74 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  28.11 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  28.66 
 
 		 187 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  28.66 
 
 		 187 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  28.66 
 
 		 187 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  28.18 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  29.11 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29987  predicted protein  30.06 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.247695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  27.93 
 
 		 197 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  29.68 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  25.52 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  27.97 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  27.62 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  32.45 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  28.83 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  27.61 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  27.22 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  25.97 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  29.14 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  29.08 
 
 		 217 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  28.97 
 
 		 188 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  28.95 
 
 		 187 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  28.67 
 
 		 189 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  29.14 
 
 		 187 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  27.78 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  28.37 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  29.45 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  28.83 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  28.83 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  28.36 
 
 		 190 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  29.25 
 
 		 188 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  27.97 
 
 		 189 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  28 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  28 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  28 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  26.14 
 
 		 186 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  32.59 
 
 		 189 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  29.61 
 
 		 200 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  28 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  28 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>