More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3350 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3551  dihydroxy-acid dehydratase  65.2 
 
 		 607 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347944  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07358  hypothetical dihydroxy-acid dehydratase (Eurofung)  59.12 
 
 		 651 aa  716    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1998  dihydroxy-acid dehydratase  66.5 
 
 		 604 aa  780    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1326  dihydroxy-acid dehydratase  62.67 
 
 		 599 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214365  normal  0.115869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0940  dihydroxy-acid dehydratase  63.06 
 
 		 601 aa  768    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234508  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4194  dihydroxy-acid dehydratase  65.59 
 
 		 594 aa  774    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04770  dihydroxy-acid dehydratase, putative  59.02 
 
 		 636 aa  691    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4082  dihydroxy-acid dehydratase  65.59 
 
 		 594 aa  774    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0176  dihydroxy-acid dehydratase  67 
 
 		 593 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3093  dihydroxy-acid dehydratase  95.12 
 
 		 594 aa  1169    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0227397 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6298  dihydroxy-acid dehydratase  64.76 
 
 		 593 aa  787    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2095  dihydroxy-acid dehydratase  64.71 
 
 		 602 aa  781    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3116  dihydroxy-acid dehydratase  64.82 
 
 		 595 aa  796    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0987  dihydroxy-acid dehydratase  62.46 
 
 		 617 aa  758    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.076567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3694  dihydroxy-acid dehydratase  63.55 
 
 		 598 aa  779    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3648  dihydroxy-acid dehydratase  65.54 
 
 		 599 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.458648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3350  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 594 aa  1219    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.907345  hitchhiker  0.00746579 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1359  dihydroxy-acid dehydratase  63.58 
 
 		 594 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188319  normal  0.638946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3324  dihydroxy-acid dehydratase  65.04 
 
 		 602 aa  781    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1145  dihydroxy-acid dehydratase  64 
 
 		 600 aa  778    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3617  dihydroxy-acid dehydratase  61.45 
 
 		 599 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.886843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1810  dihydroxy-acid dehydratase  66.84 
 
 		 593 aa  815    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6461  dihydroxy-acid dehydratase  64.92 
 
 		 593 aa  789    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1421  dihydroxy-acid dehydratase  63.06 
 
 		 601 aa  769    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4493  dihydroxy-acid dehydratase  72.53 
 
 		 586 aa  894    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0882  dihydroxy-acid dehydratase  63.06 
 
 		 601 aa  769    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3613  dihydroxy-acid dehydratase  61.17 
 
 		 600 aa  737    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2904  dihydroxy-acid dehydratase  62.83 
 
 		 601 aa  714    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0861  dihydroxy-acid dehydratase  62.48 
 
 		 594 aa  774    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2875  dihydroxy-acid dehydratase  63.39 
 
 		 599 aa  742    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284792  normal  0.328193 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6696  dihydroxy-acid dehydratase  64.92 
 
 		 593 aa  789    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4905  dihydroxy-acid dehydratase  65.48 
 
 		 603 aa  764    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.751996  hitchhiker  0.00289636 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4584  dihydroxy-acid dehydratase  64.76 
 
 		 593 aa  753    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2457  dihydroxy-acid dehydratase  73.05 
 
 		 593 aa  901    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000103031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4003  dihydroxy-acid dehydratase  74.54 
 
 		 597 aa  946    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1675  dihydroxy-acid dehydratase  65.65 
 
 		 603 aa  763    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.75973  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0087  dihydroxy-acid dehydratase  63.58 
 
 		 593 aa  768    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1467  dihydroxy-acid dehydratase  67.35 
 
 		 593 aa  811    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.454096  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2488  dihydroxy-acid dehydratase  90.63 
 
 		 592 aa  1117    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0754  dihydroxy-acid dehydratase  74.79 
 
 		 593 aa  904    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6403  dihydroxy-acid dehydratase  63.16 
 
 		 595 aa  772    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6168  dihydroxy-acid dehydratase  60.37 
 
 		 598 aa  727    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.017336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3962  dihydroxy-acid dehydratase  64.21 
 
 		 602 aa  784    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0940  dihydroxy-acid dehydratase  70.37 
 
 		 592 aa  879    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  45.09 
 
 		 581 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  44.98 
 
 		 577 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  45.85 
 
 		 582 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  46.94 
 
 		 586 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  44.98 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  44.07 
 
 		 569 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  45.06 
 
 		 581 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  43.8 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  42.76 
 
 		 577 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  42.61 
 
 		 577 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  42.61 
 
 		 577 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  44.48 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  43.33 
 
 		 579 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  43.51 
 
 		 579 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  42.44 
 
 		 586 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  43.73 
 
 		 578 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  43.29 
 
 		 577 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  43.36 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  43 
 
 		 581 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  43.62 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  42.55 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  43.38 
 
 		 578 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  42.21 
 
 		 580 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  44.07 
 
 		 600 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  42.13 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  43.05 
 
 		 578 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  44.11 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  43.19 
 
 		 579 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  40.95 
 
 		 580 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  42.42 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  42.73 
 
 		 578 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  42.71 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  41.78 
 
 		 583 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  42.28 
 
 		 577 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  42.13 
 
 		 577 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  41.95 
 
 		 583 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  41.61 
 
 		 583 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  41.95 
 
 		 583 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  42.15 
 
 		 579 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  41.78 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  41.61 
 
 		 583 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  41.78 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  42.36 
 
 		 570 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  41.44 
 
 		 583 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  42.21 
 
 		 574 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  42.41 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  42.16 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  41.61 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  41.51 
 
 		 583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  42.48 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  43.18 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  41.45 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  41.8 
 
 		 569 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5697  dihydroxy-acid dehydratase  41.33 
 
 		 587 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  41.77 
 
 		 578 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  40.93 
 
 		 575 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>