More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4493 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07358  hypothetical dihydroxy-acid dehydratase (Eurofung)  55.91 
 
 
651 aa  674    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6403  dihydroxy-acid dehydratase  61.32 
 
 
595 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1810  dihydroxy-acid dehydratase  65.76 
 
 
593 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0087  dihydroxy-acid dehydratase  62.23 
 
 
593 aa  740    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0940  dihydroxy-acid dehydratase  59.8 
 
 
601 aa  729    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234508  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1467  dihydroxy-acid dehydratase  66.84 
 
 
593 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.454096  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6298  dihydroxy-acid dehydratase  65.09 
 
 
593 aa  769    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2875  dihydroxy-acid dehydratase  60.64 
 
 
599 aa  709    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284792  normal  0.328193 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04770  dihydroxy-acid dehydratase, putative  56.37 
 
 
636 aa  648    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1421  dihydroxy-acid dehydratase  59.3 
 
 
601 aa  729    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0176  dihydroxy-acid dehydratase  65.93 
 
 
593 aa  773    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2904  dihydroxy-acid dehydratase  61.19 
 
 
601 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.795928  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0861  dihydroxy-acid dehydratase  62.01 
 
 
594 aa  738    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.159597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3613  dihydroxy-acid dehydratase  59.63 
 
 
600 aa  704    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3551  dihydroxy-acid dehydratase  63.51 
 
 
607 aa  763    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347944  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2095  dihydroxy-acid dehydratase  63.46 
 
 
602 aa  767    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682042 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3694  dihydroxy-acid dehydratase  62.93 
 
 
598 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0987  dihydroxy-acid dehydratase  63.48 
 
 
617 aa  749    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.076567  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3648  dihydroxy-acid dehydratase  64.19 
 
 
599 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.458648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3350  dihydroxy-acid dehydratase  72.53 
 
 
594 aa  894    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.907345  hitchhiker  0.00746579 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1359  dihydroxy-acid dehydratase  64.12 
 
 
594 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188319  normal  0.638946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4905  dihydroxy-acid dehydratase  61.25 
 
 
603 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.751996  hitchhiker  0.00289636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3324  dihydroxy-acid dehydratase  64.19 
 
 
602 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1145  dihydroxy-acid dehydratase  63.11 
 
 
600 aa  748    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3116  dihydroxy-acid dehydratase  64.71 
 
 
595 aa  759    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583014  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6461  dihydroxy-acid dehydratase  65.09 
 
 
593 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4493  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
586 aa  1192    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4584  dihydroxy-acid dehydratase  64.42 
 
 
593 aa  737    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4003  dihydroxy-acid dehydratase  68.21 
 
 
597 aa  851    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1998  dihydroxy-acid dehydratase  63.7 
 
 
604 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701695  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6696  dihydroxy-acid dehydratase  65.09 
 
 
593 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2457  dihydroxy-acid dehydratase  68.97 
 
 
593 aa  829    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000103031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4194  dihydroxy-acid dehydratase  65.65 
 
 
594 aa  745    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1326  dihydroxy-acid dehydratase  60.14 
 
 
599 aa  692    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214365  normal  0.115869 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0882  dihydroxy-acid dehydratase  59.8 
 
 
601 aa  730    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3962  dihydroxy-acid dehydratase  63.85 
 
 
602 aa  766    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0754  dihydroxy-acid dehydratase  68.59 
 
 
593 aa  815    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6168  dihydroxy-acid dehydratase  63.6 
 
 
598 aa  729    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.017336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1675  dihydroxy-acid dehydratase  61.59 
 
 
603 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.75973  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3617  dihydroxy-acid dehydratase  59.73 
 
 
599 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.886843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0940  dihydroxy-acid dehydratase  69.64 
 
 
592 aa  838    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4082  dihydroxy-acid dehydratase  65.65 
 
 
594 aa  745    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2488  dihydroxy-acid dehydratase  72.5 
 
 
592 aa  895    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3093  dihydroxy-acid dehydratase  72.01 
 
 
594 aa  888    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0227397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2062  dihydroxy-acid dehydratase  45.25 
 
 
577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000158328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2144  dihydroxy-acid dehydratase  44.12 
 
 
577 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00293618  normal  0.802543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1983  dihydroxy-acid dehydratase  44.14 
 
 
577 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000233691  normal  0.0422763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1991  dihydroxy-acid dehydratase  44.14 
 
 
577 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134932  unclonable  0.0000282177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2070  dihydroxy-acid dehydratase  43.8 
 
 
586 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000109007  hitchhiker  0.0000050577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1995  dihydroxy-acid dehydratase  43.97 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308211  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4105  dihydroxy-acid dehydratase  43.08 
 
 
586 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000339797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3170  dihydroxy-acid dehydratase  43.15 
 
 
579 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4478  dihydroxy-acid dehydratase  43.4 
 
 
581 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.724246  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3909  dihydroxy-acid dehydratase  43.4 
 
 
569 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3963  dihydroxy-acid dehydratase  43.46 
 
 
577 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49250  dihydroxy-acid dehydratase  44.93 
 
 
578 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2909  dihydroxy-acid dehydratase  42.81 
 
 
579 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2595  dihydroxy-acid dehydratase  44.22 
 
 
578 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0842  dihydroxy-acid dehydratase  43.33 
 
 
581 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569101  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4246  dihydroxy-acid dehydratase  43.8 
 
 
582 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3227  dihydroxy-acid dehydratase  43.9 
 
 
578 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473897  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4479  dihydroxy-acid dehydratase  43.05 
 
 
577 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261735  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3005  dihydroxy-acid dehydratase  43.92 
 
 
578 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0456  dihydroxy-acid dehydratase  43.68 
 
 
579 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3451  dihydroxy-acid dehydratase  42.54 
 
 
570 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3772  dihydroxy-acid dehydratase, putative  42.71 
 
 
580 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.204786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1142  dihydroxy-acid dehydratase  42.62 
 
 
581 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1708  dihydroxy-acid dehydratase  42.71 
 
 
580 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2132  dihydroxy-acid dehydratase  42.66 
 
 
578 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2666  dihydroxy-acid dehydratase  42.56 
 
 
579 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37627  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1022  dihydroxy-acid dehydratase  42.66 
 
 
600 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3689  dihydroxy-acid dehydratase  43.1 
 
 
578 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1051  dihydroxy-acid dehydratase  42.52 
 
 
583 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4215  dihydroxy-acid dehydratase  42.55 
 
 
580 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4585  dihydroxy-acid dehydratase  42.52 
 
 
583 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3202  dihydroxy-acid dehydratase  42.52 
 
 
583 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6714  dihydroxy-acid dehydratase  42.74 
 
 
577 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.790369  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2248  dihydroxy-acid dehydratase  43.46 
 
 
577 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0766629  hitchhiker  0.00000565085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5480  dihydroxy-acid dehydratase  42.18 
 
 
583 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0215246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0041  dihydroxy-acid dehydratase  42.18 
 
 
583 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5215  dihydroxy-acid dehydratase  42.35 
 
 
583 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4925  dihydroxy-acid dehydratase  42.18 
 
 
583 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5644  dihydroxy-acid dehydratase  42.35 
 
 
583 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0213778  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1829  Dihydroxy-acid dehydratase  43.32 
 
 
568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3540  dihydroxy-acid dehydratase  43.55 
 
 
569 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3803  dihydroxy-acid dehydratase  40.27 
 
 
580 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2315  Dihydroxy-acid dehydratase  40.76 
 
 
570 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123092  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1632  dihydroxy-acid dehydratase  42.19 
 
 
583 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66884  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3532  dihydroxy-acid dehydratase  42.15 
 
 
579 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3487  dihydroxy-acid dehydratase  41.52 
 
 
571 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.87746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1244  dihydroxy-acid dehydratase  42.35 
 
 
569 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.411371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0740  dihydroxy-acid dehydratase  42.61 
 
 
577 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4589  dihydroxy-acid dehydratase  41.93 
 
 
579 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4563  Dihydroxy-acid dehydratase  41.68 
 
 
572 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3081  dihydroxy-acid dehydratase  41.65 
 
 
578 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.126248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2442  Dihydroxy-acid dehydratase  43.81 
 
 
569 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0434  dihydroxy-acid dehydratase  40.93 
 
 
574 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.325257  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1288  dihydroxy-acid dehydratase  41.3 
 
 
578 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0135195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0196  Dihydroxy-acid dehydratase  42.86 
 
 
575 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4447  dihydroxy-acid dehydratase  40.46 
 
 
586 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>