132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2048 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  95.27 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  82.39 
 
 		 148 aa  247  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  66.22 
 
 		 151 aa  202  9e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  69.72 
 
 		 173 aa  200  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  66.22 
 
 		 151 aa  200  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  67.13 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  66.22 
 
 		 151 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  61.38 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  67.38 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  66.9 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  65.25 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  65.25 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  65.97 
 
 		 148 aa  190  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  60.28 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.24 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  61.15 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  61.81 
 
 		 157 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.81 
 
 		 157 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  60 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.33 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  58.7 
 
 		 159 aa  171  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  58.04 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  60.28 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  46.81 
 
 		 145 aa  143  9e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  53.57 
 
 		 166 aa  140  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  47.58 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  45.26 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  45.31 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  42.42 
 
 		 145 aa  114  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  46.67 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  47.5 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  47.5 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  41.27 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  39.52 
 
 		 172 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  40.91 
 
 		 164 aa  87.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.79 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.5 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  35.66 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.68 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.58 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.89 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  22.96 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  22.96 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.61 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.57 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.76 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  25.9 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.19 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.61 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  25.18 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  24.44 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  25.17 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.41 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  23.81 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  24.14 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.44 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  17.97 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.24 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  28 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  24.24 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  24.24 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  24.24 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.24 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.24 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  24.24 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.76 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.37 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  21.68 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.47 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.68 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  24.22 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  22.96 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.97 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  28.92 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  23.45 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.73 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.44 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.66 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.75 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.82 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  23.33 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  23 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  23.4 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.82 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  28.75 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  27.08 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.49 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  25.85 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1570  NifU domain-containing protein  26.83 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0108817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  25.53 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.53 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.53 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.85 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.57 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.63 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  36.84 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>