122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7171 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  90 
 
 		 150 aa  275  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  80 
 
 		 157 aa  234  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  80 
 
 		 157 aa  234  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  79.86 
 
 		 153 aa  231  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  73.43 
 
 		 173 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  75.35 
 
 		 161 aa  228  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  74.31 
 
 		 151 aa  228  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  73.61 
 
 		 151 aa  227  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  74.65 
 
 		 151 aa  226  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  70 
 
 		 150 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  70 
 
 		 150 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  76.39 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  71.22 
 
 		 158 aa  216  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  65.99 
 
 		 149 aa  207  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  66.91 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  67.63 
 
 		 146 aa  196  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  67.63 
 
 		 146 aa  196  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  65.47 
 
 		 148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  64.75 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.07 
 
 		 148 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  60.14 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  61.74 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  60 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  51.72 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  47.89 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  56.8 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  53.85 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  51.85 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  48.06 
 
 		 176 aa  134  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  52.03 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  52.85 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  52.85 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  44.85 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  50.37 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  43.75 
 
 		 172 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  41.35 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  31.11 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.07 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.93 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.88 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.37 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  30.37 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  30.37 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  30.37 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.37 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  30.37 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.63 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.09 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.17 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.11 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.47 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.47 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.41 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.28 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.93 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  25.81 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.41 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  27.14 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  33.08 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  28.15 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  23.88 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.47 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.71 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.17 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.4 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.94 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  26.28 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.28 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  26.95 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  28.87 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  26.32 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  33.01 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  27.64 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.21 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  33.01 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.47 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.89 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.65 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.47 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.37 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.89 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  28.43 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.28 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.87 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.62 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.21 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.53 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  29.66 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  25.74 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.26 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.59 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  30.34 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.34 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.34 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.72 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  25.71 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.66 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.7 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>