116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1516 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  75.19 
 
 		 146 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  75.19 
 
 		 146 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  70.27 
 
 		 176 aa  196  7.999999999999999e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  72.09 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  70.75 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  57.14 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  55.15 
 
 		 158 aa  149  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.82 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  53.24 
 
 		 157 aa  146  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  55.56 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  57.04 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  49.29 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  51.85 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  48.94 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.73 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.57 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  48.91 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  52.24 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.24 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  54.29 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  47.22 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  47.14 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  48.57 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  49.26 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  47.86 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  49.26 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  43.8 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  45.83 
 
 		 151 aa  129  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.26 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  50.79 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  43.97 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.26 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  51.94 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  41.84 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  46.51 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.1 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.1 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.57 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.49 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.57 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  38.24 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.68 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.39 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.62 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.62 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.54 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  30.08 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  27.34 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  29.1 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.78 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.3 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.65 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.36 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.39 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.97 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.12 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.57 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  28.7 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.12 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.13 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.95 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  35.35 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  26.43 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.13 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.23 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.02 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.85 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.97 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.31 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.51 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.13 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.38 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  28.77 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  19.4 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.41 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.94 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.65 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.38 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.67 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.27 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.48 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  33.01 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  32.1 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  25.53 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  25.53 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.1 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.32 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.48 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.89 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  29.07 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>