More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2247 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 		 140 aa  289  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  74.63 
 
 		 143 aa  204  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  73.76 
 
 		 163 aa  204  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  69.29 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  68.31 
 
 		 143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  46.09 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  48.72 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.08 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.7 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.71 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  40.91 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  41.27 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.66 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.66 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.29 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  37.76 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  39.69 
 
 		 158 aa  93.2  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.69 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0953  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.2 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.57 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.57 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.23 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  38.93 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.75 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.46 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.38 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.38 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.61 
 
 		 207 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.1 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  37.88 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  38.58 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.77 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  39.81 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.55 
 
 		 153 aa  84.3  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.06 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  38.58 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.93 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  36.04 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  35.2 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  37.8 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  34.82 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  34.82 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  34.82 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  34.82 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  34.82 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  34.82 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  34.82 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  36.61 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  34.82 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  38.39 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  34.13 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.35 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.14 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  34.82 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.58 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  36.94 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  38.57 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.57 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.57 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  37.17 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.35 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.78 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  33.93 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  33.93 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  33.93 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  33.93 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  33.93 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.81 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  38.35 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.81 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.81 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.23 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  37.5 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.46 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  33.6 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.14 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  33.04 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  35.14 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  34.23 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.45 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  34.82 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  32.14 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>