More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0498 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  100 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  56.78 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  47.46 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  46.67 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.23 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.86 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.81 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  42.5 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.15 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.4 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.72 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.09 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.29 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.97 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  33.59 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.46 
 
 		 207 aa  89.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.29 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  40.34 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.37 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.37 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  35.14 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  34.97 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  38.02 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.6 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.46 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  31.65 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.6 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.67 
 
 		 284 aa  88.2  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.21 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.94 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  36.89 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  35.77 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  38.1 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.48 
 
 		 211 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.59 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  31.62 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  37.4 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  33.78 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.78 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  33.78 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  33.09 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  33.78 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  33.56 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  33.78 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.78 
 
 		 163 aa  84.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.81 
 
 		 149 aa  84.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.78 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.71 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  33.57 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  36.15 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.61 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.71 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  32.61 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.07 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  35.77 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  34.68 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.96 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.14 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.52 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  32.89 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.56 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.82 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.66 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.41 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.41 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.96 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.11 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  33.86 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.43 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.77 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.82 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  33.88 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  35.16 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  34.43 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  36.43 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  33.59 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.14 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  32.06 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  34.13 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  35.71 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.4 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.34 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.08 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  32.54 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  32.54 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  32.54 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  32.54 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  32.54 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  34.38 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  32.54 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  32.54 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  34.43 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  32.54 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  31.97 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  30.6 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.43 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.09 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>