More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0047 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  100 
 
 		 135 aa  263  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  53.79 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  53.79 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  50 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.77 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 163 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.94 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.7 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  36.3 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.56 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.56 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.94 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.56 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.69 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  38.52 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.31 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.31 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  38.52 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0398  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.69 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.84 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.13 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.84 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  32.84 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.84 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.41 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  35.77 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  34.81 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  35.34 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.06 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1070  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.44 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.06 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  35.34 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  33.58 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.18 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  37.78 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  36.43 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.58 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.85 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.84 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  32.09 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.09 
 
 		 149 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  34.85 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.09 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  40 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.33 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.59 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  35.34 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  36.09 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.34 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.22 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12880  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.38 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  31.82 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  32.33 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.15 
 
 		 151 aa  90.5  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.22 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  39.32 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.17 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.1 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.85 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.66 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.37 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.64 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.14 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.64 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.75 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.24 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.61 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.5 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.38 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.59 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.88 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.69 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.51 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  31.34 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  34.51 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.51 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2053  NifU domain-containing protein  39.13 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.415003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  37.31 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  37.31 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  37.31 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  37.31 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.31 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  37.31 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.31 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.31 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  37.31 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.36 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.31 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  34.65 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.82 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.85 
 
 		 171 aa  80.1  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.3 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.59 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.67 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.41 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  29.71 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>