223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13390 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 		 163 aa  336  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  58.57 
 
 		 167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  60 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.16 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  58.87 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  56.74 
 
 		 153 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  56.43 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  56.74 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  56.94 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  56.94 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  56.94 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  53.19 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  51.02 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  55.94 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  50.32 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  55 
 
 		 150 aa  160  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  52.41 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  54.61 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  51.06 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  53.9 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  55.41 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  50.69 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  51.06 
 
 		 145 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.28 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  53.24 
 
 		 155 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3078  NifU family SUF system FeS assembly protein  54.3 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167444  normal  0.201859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  48.3 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.34 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  47.3 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  48.32 
 
 		 155 aa  131  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1676  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.72 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.74 
 
 		 178 aa  120  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2335  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.23 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610109  normal  0.712132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  38 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.22 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.73 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  42.25 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0602  hypothetical protein  38.32 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.547374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.25 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  42.25 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  38.62 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  41.43 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.5 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.5 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  40.71 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  40.71 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  40.71 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.71 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  40.71 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.71 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  37.59 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.86 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  40 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.04 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.04 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.32 
 
 		 233 aa  94.7  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.820137 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  37.59 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.67 
 
 		 149 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.73 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.85 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  37.59 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.3 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.32 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.13 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.14 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.5 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  32.61 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  38.03 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  38.03 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.57 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  37.86 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.57 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.13 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.16 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  38.26 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.04 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.69 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  41.04 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.99 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  33.09 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.25 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  34.53 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.21 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  40.85 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  35.92 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  29.66 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  30.99 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.99 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  33.82 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.82 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  34.04 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  39.82 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.17 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  35.46 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  35.46 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  35.46 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  35.46 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>