More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1321 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 142 aa  293  8e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  45.83 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  46.02 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.35 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.8 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.86 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.83 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.48 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.34 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.52 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.19 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  36.64 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  44.44 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.71 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.82 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  38.74 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.78 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  33.85 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  38.79 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.79 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.61 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.23 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.68 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  45.12 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.97 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.14 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.14 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.28 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.66 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  36.67 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.09 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  34.56 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.9 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.97 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.34 
 
 		 207 aa  73.6  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.01 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.93 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  30.56 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  40 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  30.56 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  34.23 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.59 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12880  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.88 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.59 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  35.04 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.34 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  39.78 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.21 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  32.21 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.21 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.84 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  30.71 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.55 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.93 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.55 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.93 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.08 
 
 		 277 aa  70.1  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.84 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  39.76 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.76 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.76 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  31.78 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  42.17 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.3 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.53 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  33.81 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.84 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1570  NifU domain-containing protein  39.76 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0108817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0398  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.79 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.66 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.13 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.55 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  29.63 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  31.78 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.77 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.77 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  39.56 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.29 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.17 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.22 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.34 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.64 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  33.33 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  33.57 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.85 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  32.54 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.71 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  31.21 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  32.43 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  39.76 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  30.28 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.89 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>