More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0719 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  72.22 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.91 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  53.66 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0953  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.95 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0977  nitrogen-fixing NifU-like protein  42.86 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.84 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.18 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.27 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.74 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  38.89 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.09 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.64 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.94 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.11 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.64 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.46 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.83 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.05 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  35.11 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  36.84 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.13 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.34 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  44.05 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.82 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.51 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  34.88 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.04 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  34.88 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  34.88 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.6 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.77 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  33.04 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.21 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.4 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.4 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  34.62 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.6 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.59 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.04 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.53 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  34.78 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  30.77 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  32.82 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  45.07 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  32.37 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.82 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.06 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  34.78 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  43.66 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.36 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  30.95 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  34.45 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.59 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.04 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  30.08 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.59 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.3 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  32 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.46 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  30.3 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  30.08 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.25 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.3 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  33.33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  29.27 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  29.27 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  35.9 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.5 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  30.17 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.81 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  33.33 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  30 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  29.27 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  30.89 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.77 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  31.67 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.27 
 
 		 284 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  35.38 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  29.27 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  29.27 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  29.27 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  29.27 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.58 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  29.27 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  29.27 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  32.5 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  32.77 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  29.27 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.72 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.23 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  30.08 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  32.52 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  31.67 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  30.08 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  31.67 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>