More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0953 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0953  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
128 aa  256  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  51.33 
 
 
134 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  50.43 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  46.9 
 
 
129 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.66 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.52 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.44 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.29 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  38.79 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.07 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.04 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0977  nitrogen-fixing NifU-like protein  36.36 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.9 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.63 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  38.21 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  32.82 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  32.82 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  32.06 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  33.85 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.11 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  36 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  33.62 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  28.7 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.78 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  31.9 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  33.58 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  32.76 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  31.3 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.99 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.99 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  32.58 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.74 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.19 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.86 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.17 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  32.54 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  33.62 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.54 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  30.17 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  31.9 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05220  iron-sulfur cluster assembly-related protein, putative  31.3 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  28.7 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  28.7 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.11 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  31.9 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  31.9 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  31.9 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  31.9 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.95 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  31.03 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  31.9 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  29.57 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  28.81 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  31.9 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  29.41 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.73 
 
 
207 aa  60.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  32.76 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.03 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  30.51 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.1 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.1 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  30.51 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.34 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  30.17 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  28.8 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  27.83 
 
 
127 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.6 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  31.03 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.94 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  27.83 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  31.03 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  29.6 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.25 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.09 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.46 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  31.03 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.94 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  31.09 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  26.96 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.82 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  30.77 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>