145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0963 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  100 
 
 		 152 aa  306  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  31.16 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  35.34 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  26.03 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.47 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.47 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.47 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  27.54 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  30.08 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  27.56 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.93 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  30.71 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  29.93 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  27.91 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  29.41 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  27.41 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  27.41 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  28.15 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.93 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.4 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  29.08 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  27.41 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.12 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.19 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  33.08 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.56 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  26.32 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  32.06 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  26.47 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  28.57 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.86 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  25.76 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  26.32 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  27.21 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  28.87 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  30 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.87 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.53 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  29.69 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  26.02 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  33.08 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  31.31 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.29 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.24 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  25 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.43 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.43 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.03 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  25 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.03 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.13 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.76 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.82 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.67 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.57 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  24.82 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.17 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.87 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  23.91 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  22.22 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  27.41 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1570  NifU domain-containing protein  32 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0108817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.83 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.41 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.47 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  27.42 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.41 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  27.42 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  28.23 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.14 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  24.64 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  29.2 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  30.56 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.2 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  25.93 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  27.2 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.2 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.48 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  28.89 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  23.19 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.09 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.95 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.65 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  24.03 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.77 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  23.91 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.49 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.57 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.14 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  21.88 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.85 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  21.88 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.96 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>