108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2502 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  70.27 
 
 		 149 aa  213  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  71.88 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  71.88 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  68.75 
 
 		 146 aa  183  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  64 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  56.12 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  52.94 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  51.85 
 
 		 150 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.66 
 
 		 149 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  46.48 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  58.33 
 
 		 153 aa  141  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  48.94 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  41.1 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  52.99 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.73 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.99 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  48.46 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  44.37 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  44.44 
 
 		 151 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  47.41 
 
 		 150 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  43.06 
 
 		 151 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  45.32 
 
 		 148 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  46.1 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.88 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  45.32 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  44.68 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  44.68 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  47.86 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  40.58 
 
 		 145 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  49.21 
 
 		 154 aa  114  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  49.6 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.44 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  38.97 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.71 
 
 		 148 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  37.76 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  40.31 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.29 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.1 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.48 
 
 		 132 aa  62  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.01 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  30.83 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  37.31 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  31.29 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  32.89 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.62 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.07 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.1 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.25 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  31.25 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36 
 
 		 130 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  28.97 
 
 		 150 aa  51.2  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  23.74 
 
 		 135 aa  51.2  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.72 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.61 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.3 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.73 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  29.81 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.25 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.25 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.82 
 
 		 142 aa  48.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.87 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32 
 
 		 141 aa  47.8  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  29.81 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.81 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.81 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.84 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.26 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.43 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.81 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.79 
 
 		 139 aa  44.7  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29 
 
 		 139 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  23.7 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  23.7 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.42 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  30.59 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  29.67 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.37 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.93 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.93 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.67 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.17 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  35.21 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.88 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.4 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  30 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.7 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.26 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  21.77 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.21 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.58 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.37 
 
 		 144 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.37 
 
 		 144 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  29.81 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  30.38 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.72 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12880  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.41 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>