136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2223 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 153 aa  303  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  89.81 
 
 		 157 aa  278  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  89.81 
 
 		 157 aa  278  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  82.64 
 
 		 157 aa  239  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  79.86 
 
 		 150 aa  231  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  78.08 
 
 		 150 aa  226  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  73.61 
 
 		 151 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  74.31 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.93 
 
 		 150 aa  223  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  70.34 
 
 		 151 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  68.67 
 
 		 151 aa  218  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  70.14 
 
 		 173 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  68.67 
 
 		 150 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  73.05 
 
 		 158 aa  211  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  73.76 
 
 		 148 aa  210  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  68.03 
 
 		 146 aa  207  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.92 
 
 		 149 aa  206  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  68.09 
 
 		 159 aa  205  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  69.5 
 
 		 146 aa  202  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  69.5 
 
 		 146 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  64.1 
 
 		 166 aa  190  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  65.97 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.94 
 
 		 148 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.24 
 
 		 148 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  47.95 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  52.74 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  55.91 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  53.73 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  54.69 
 
 		 176 aa  136  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  48.48 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  54.92 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  54.92 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  54.92 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  46.67 
 
 		 145 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  52.24 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  43.41 
 
 		 172 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  40.77 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.54 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  31.54 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  31.54 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  31.54 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.54 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  31.54 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.87 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  30.77 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.1 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  29.53 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  34.56 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.37 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.41 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.39 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.4 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  29.93 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.99 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.12 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  27.89 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.4 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  27.78 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.43 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.86 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.16 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.86 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.66 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.58 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.5 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.92 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  26.95 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.78 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.56 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.87 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  27.86 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.03 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  28.26 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.71 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  28.37 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.37 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.37 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.26 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  27.86 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.86 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  31.97 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.06 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  25.2 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.26 
 
 		 277 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.41 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  24.09 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.06 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.06 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.47 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.85 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.14 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.54 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.5 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.45 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.16 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  29.17 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  25.4 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.82 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>