164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2157 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  300  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  87.67 
 
 
146 aa  274  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  87.67 
 
 
146 aa  274  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  77.62 
 
 
148 aa  237  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  67.13 
 
 
151 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  67.13 
 
 
161 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.14 
 
 
157 aa  207  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  68.03 
 
 
153 aa  207  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  70.14 
 
 
157 aa  207  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  64.38 
 
 
173 aa  206  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  64.38 
 
 
150 aa  203  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  62.76 
 
 
151 aa  203  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  63.45 
 
 
151 aa  202  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  64.79 
 
 
148 aa  201  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  65.31 
 
 
157 aa  200  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  63.38 
 
 
150 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.86 
 
 
149 aa  197  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  65 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  63.01 
 
 
150 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  61.15 
 
 
159 aa  192  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  64.75 
 
 
150 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.7 
 
 
148 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.28 
 
 
148 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  52.08 
 
 
147 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  50.69 
 
 
145 aa  163  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  56.03 
 
 
166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  52 
 
 
153 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  48.91 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  48.41 
 
 
176 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  46.92 
 
 
154 aa  127  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  44.7 
 
 
145 aa  124  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  49.17 
 
 
146 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  47.5 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  47.5 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  44.37 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  40.62 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.15 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.15 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.79 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.08 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.65 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  35.66 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.67 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.34 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.11 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.14 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.26 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.26 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  29.75 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  30.37 
 
 
172 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.47 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.34 
 
 
163 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.53 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.52 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  26.52 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  31.43 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  24.43 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  26.52 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  26.52 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.52 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  26.52 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  27.27 
 
 
158 aa  57.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.47 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.47 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.74 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.27 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  29.01 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  27.54 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.69 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  34.56 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.57 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.59 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.49 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  32.64 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.91 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.28 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.06 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.39 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  28.97 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  22.86 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.97 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.08 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.56 
 
 
137 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  23.66 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  23.66 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.67 
 
 
146 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  22.14 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.8 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  21.99 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.91 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2053  NifU domain-containing protein  31.58 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.415003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.08 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  28.24 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.09 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.09 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  26.58 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  27.01 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  25.2 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0595  NifU domain-containing protein  28.87 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>