More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0595 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0595  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  44.17 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.13 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  36.67 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  40.34 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  40 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38.66 
 
 		 127 aa  93.6  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  40.83 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.89 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.97 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  36.97 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  35.54 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.19 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1593  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.85 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  34.4 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.34 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.83 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.13 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.5 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  39.66 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  33.6 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0447  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  37.07 
 
 		 173 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  35.48 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  35.29 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  34.17 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.67 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  38.14 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  40.32 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.04 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.36 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  33.61 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  39.02 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  39.02 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  39.02 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  39.02 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  39.02 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.88 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  38.1 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  39.17 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  39.02 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  39.02 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  39.02 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  39.02 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.71 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  35.59 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.59 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  37.9 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  38.71 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.7 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.19 
 
 		 277 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  37.9 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0021  NifU-like protein  40.17 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.13876e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  37.93 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  31.9 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  36.36 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  35.77 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  35.77 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.9 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  40.32 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.9 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.05 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.05 
 
 		 284 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  35.71 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  34.96 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.05 
 
 		 284 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0579  NifU domain-containing protein  38 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.503517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  33.33 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  35.77 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  36.59 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  35.2 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.44 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  35.2 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.36 
 
 		 284 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  36.59 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  34.96 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  34.96 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  34.4 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  34.15 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  35.77 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  36.59 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  35.48 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  35.48 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  34.96 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  37.6 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.77 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  35.77 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.44 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  32.2 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>