45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1804 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  100 
 
 		 142 aa  274  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  47.24 
 
 		 172 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  46.81 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  48.85 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  41.67 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  37.93 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  40.69 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  39.19 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  40.82 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  38.26 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  40 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  38.1 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  41.38 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.38 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  39.46 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.69 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.69 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  40.31 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.24 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  41.35 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  39.52 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  40.32 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  40.32 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  37.04 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  36.43 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  35 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  35.57 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  34.9 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  34.9 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.24 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  39.67 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  34.72 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  38.69 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.36 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  30.6 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  27.4 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.58 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.7 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.33 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.32 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  26.32 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>