46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1954 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  276  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  48 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.56 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  33.83 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  39.81 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  38.24 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.81 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  37.31 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  34.56 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  37.01 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  33.08 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  42 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  33.83 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  31.88 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  30.37 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  35.19 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.26 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  32.71 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  34.26 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  34.26 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  32.71 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  42 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  33.33 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  32.59 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  32.82 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  32.82 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.26 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  39 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  39 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.87 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.32 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  38.14 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  29.41 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  27.72 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1570  NifU domain-containing protein  33.87 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0108817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  28.89 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  26.32 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  35.23 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  35.34 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.56 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.04 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.69 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  22.39 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.63 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.63 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>