101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2395 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  306  6.999999999999999e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  55.56 
 
 
150 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  56.3 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  55.56 
 
 
150 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  51.85 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  51.82 
 
 
157 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  51.47 
 
 
157 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.82 
 
 
157 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  50.37 
 
 
173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  51.11 
 
 
151 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  50.37 
 
 
151 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  49.63 
 
 
161 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.36 
 
 
153 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  56.45 
 
 
153 aa  141  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.89 
 
 
150 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  48.89 
 
 
150 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
149 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  50 
 
 
159 aa  136  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  48.51 
 
 
146 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  50.75 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  46.88 
 
 
166 aa  130  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  47.76 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  47.76 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.37 
 
 
148 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  45.93 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.37 
 
 
148 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  51.16 
 
 
149 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  47.45 
 
 
145 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  44.7 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  52.89 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  39.26 
 
 
145 aa  114  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  49.21 
 
 
176 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  51.24 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  51.24 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  47.52 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  45.31 
 
 
172 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  41.35 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.33 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  28.68 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.86 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  28.86 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  28.86 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  28.86 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.86 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  28.86 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.83 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  25.83 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.86 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  42.06 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  28.38 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.69 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  27.01 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1570  NifU domain-containing protein  32.56 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0108817  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  26.52 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.27 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.3 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  22.63 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.66 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  20.31 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  22.63 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.68 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.39 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.58 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.61 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  23.08 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.06 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.21 
 
 
149 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  25 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  25 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.55 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  27.12 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  26.62 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  26.27 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  28.95 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  22.31 
 
 
137 aa  43.9  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  23.68 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  22.31 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  23.17 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  25.52 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.19 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  25.71 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  25.51 
 
 
139 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.28 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  24.11 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  25.71 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  23.31 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  23.31 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.93 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  23.13 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  23.71 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.19 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  27.27 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.27 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.27 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.43 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  23.58 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.24 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.23 
 
 
157 aa  40.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.69 
 
 
158 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.63 
 
 
130 aa  40.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>