119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2666 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  64.1 
 
 		 153 aa  190  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  62.18 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  62.75 
 
 		 151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  63.82 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.82 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  60.26 
 
 		 151 aa  188  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  67.61 
 
 		 150 aa  184  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  60.26 
 
 		 151 aa  183  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  61.49 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.12 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  61.74 
 
 		 150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  62.68 
 
 		 158 aa  177  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  62.41 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.97 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  60.28 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  59.86 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  54.93 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  57.45 
 
 		 146 aa  154  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  57.45 
 
 		 146 aa  154  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  56.03 
 
 		 146 aa  150  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  55 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  54.61 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.57 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  54.29 
 
 		 149 aa  137  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  48.23 
 
 		 147 aa  134  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  49.23 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  48.51 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  47.41 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  51.56 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  39.44 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  46.21 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  50.78 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  50.78 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  40.56 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  45.45 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  37.96 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  26.03 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  30 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.47 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.58 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.81 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  24.48 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  30.82 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.72 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0398  SUF system FeS assembly protein, NifU family  25.35 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.87 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.91 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.45 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.87 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.08 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.26 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  31.88 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  29.17 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.45 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.1 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.08 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.95 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.24 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.9 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  28.97 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.39 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.35 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.99 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2069  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.420514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.05 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.29 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.63 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.07 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  28.77 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.56 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  28.92 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  28.37 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  31.94 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.94 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.94 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  28.37 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  31.91 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  26 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.17 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1236  NifU family SUF system FeS assembly protein  29.63 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.34 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.34 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  26.25 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  28.57 
 
 		 145 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.35 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.67 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  28.67 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3305  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.06 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2958  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.49 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.97 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.29 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  24.31 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.14 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  23.53 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>