126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1162 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1162  NifU-like protein  100 
 
 		 146 aa  286  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  0.630664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2625  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  89.92 
 
 		 146 aa  234  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1283  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  89.92 
 
 		 146 aa  234  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1516  hypothetical protein  69.66 
 
 		 149 aa  204  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.586147  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2502  hypothetical protein  67.67 
 
 		 176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4081  NifU-related protein involved in Fe-S cluster formation  63.7 
 
 		 145 aa  176  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1395  hypothetical protein  64.79 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6321  NifU domain-containing protein  53.9 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335692  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1650  NifU-like protein  53.68 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4640  NifU domain-containing protein  51.72 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0675104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7171  NifU domain-containing protein  51.06 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2266  NifU domain-containing protein  53.57 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  0.255102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2541  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.57 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112226 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1575  NifU domain-containing protein  46.1 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102552  normal  0.101007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2223  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.86 
 
 		 153 aa  135  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0357  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.2 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0303949 
 
 
-
 
NC_004310  BR1074  NifU-related protein  47.83 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1040  NifU-related protein  47.83 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.144802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2157  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3115  nitrogen-fixing NifU-like  46.1 
 
 		 151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0367152  normal  0.730417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4527  NifU domain-containing protein  55 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5184  hypothetical protein  46.1 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471729  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3873  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.39 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3249  NifU-like protein  45.39 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1005  hypothetical protein  45.65 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1328  nitrogen-fixing NifU-like  44.68 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0643  hypothetical protein  38.85 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.395619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1050  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2183  NifU-like protein  43.97 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1656  nitrogen-fixing NifU-like  44.68 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1848  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.65 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0801971  normal  0.0471012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2395  hypothetical protein  53.17 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2048  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2666  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.394338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0002  NifU-like involved in Fe-S cluster formation  52 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2208  NIFU-like protein  42.75 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329254  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1804  Fe-S cluster formation protein  39.53 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.34 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.58 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.58 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.6 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.6 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.58 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1294  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.99 
 
 		 149 aa  57  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000198269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1954  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.25 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3483  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.35 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.79 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  35.8 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.8 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.61 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.56 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  36 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.34 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  31.31 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.29 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.72 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.94 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.14 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  39.13 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  30 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16670  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.02 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0471636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.14 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.05 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.18 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.53 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  32.38 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.37 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  29.63 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.97 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  31.06 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.06 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.06 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0963  MifU-like protein, Fe-S cluster formation  29.1 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.46 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.12 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  25.93 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.86 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  30.84 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.7 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  31.03 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.67 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.71 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  31.71 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  28 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.16 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.16 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  30.56 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3313  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.08 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  27.45 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.02 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.72 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>