More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2585 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2585  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  48.68 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  46.22 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  48.37 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 237 aa  224  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  52.25 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  47.81 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  47.95 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.34 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  45.5 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3332  ABC transporter related  46.98 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  47.35 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  44.74 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  45.09 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  45.89 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.35 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  48.25 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.61 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  47.37 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  48.02 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  46.4 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  47.41 
 
 		 244 aa  215  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  43.89 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.98 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  45.5 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  44.59 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  46.93 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  46.26 
 
 		 247 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  48.2 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.7 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  46.49 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  47.53 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  43.3 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  43.3 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  47.83 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  43.61 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.89 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  48.89 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  45.25 
 
 		 239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  45.06 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  43.17 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 		 234 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  46.02 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  44.74 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  42.86 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.75 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  43.97 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  43.1 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  45.11 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  43.3 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  43.3 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  42.41 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  47.32 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  46.49 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  44.2 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 245 aa  207  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  42.86 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4102  ABC transporter related  45.73 
 
 		 249 aa  207  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  45.98 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  44.64 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  45.09 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3649  ABC transporter related  48.66 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.5266  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  42.86 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  45.98 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  46.4 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  42.86 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  46.88 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  43.84 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  42.86 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  45.95 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.86 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  47.3 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  41.03 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  48.21 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>