134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1433 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1433  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 471 aa  959    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0125  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.21 
 
 		 541 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4194  C-5 cytosine-specific DNA methylase  45.99 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.741265 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2746  C-5 cytosine-specific DNA methylase  42.7 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4299  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.48 
 
 		 467 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0340  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.21 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0118  type II DNA-methyltransferase, putative  25.6 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.617459  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  26.64 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.87 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  25.27 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  26.13 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  26.53 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  27.43 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  24.1 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0058  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  24.26 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.192929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  36.04 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  23.91 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  28.91 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  21.85 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  24.8 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  26.26 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  24.64 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  22.05 
 
 		 313 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  23.4 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  21.51 
 
 		 657 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.26 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  24.31 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  28.7 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 		 329 aa  57  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.19 
 
 		 671 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.37 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.09 
 
 		 418 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  24.84 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  25.63 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  23.26 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  24.26 
 
 		 338 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  28.65 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  27.72 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  28.65 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  28.65 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  28.65 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  28.65 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  24.01 
 
 		 310 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  21.3 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  21.3 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  21.97 
 
 		 465 aa  53.5  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  20.83 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  26.02 
 
 		 365 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  28.12 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.34 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  23.11 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.19 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  27.41 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  27.41 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  27.41 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  27.41 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  27.41 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.46 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  23.9 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  25.09 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 		 334 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  23.99 
 
 		 329 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  23.67 
 
 		 362 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.14 
 
 		 395 aa  50.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 		 490 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  24.48 
 
 		 319 aa  50.1  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  25.78 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  21.15 
 
 		 311 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  23.53 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 		 317 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  22.94 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  27.32 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  25.19 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2374  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.53 
 
 		 636 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0270809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.46 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  24.07 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  23.75 
 
 		 308 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  22.38 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  24.48 
 
 		 359 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  22.22 
 
 		 698 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 		 323 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 		 320 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.32 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  20.88 
 
 		 366 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.4 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  21.83 
 
 		 686 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  23.65 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  23.28 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.41 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  28.45 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>