169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0340 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0340  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 473 aa  964    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0125  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.42 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2746  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.94 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4194  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.65 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.741265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1433  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.21 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4299  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.52 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.96 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  25.99 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  27.57 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.22 
 
 		 727 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 		 331 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  31.64 
 
 		 652 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  24.65 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  26.87 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  28.16 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.58 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0118  type II DNA-methyltransferase, putative  21.67 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.617459  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  26.87 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  26.2 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 		 671 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  23.28 
 
 		 317 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  25.41 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25.75 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  35.04 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  27.47 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  27.47 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  27.47 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  33.9 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  26.37 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  27.47 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  27.47 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.736012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  26.37 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  26.37 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  26.37 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 		 310 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.38 
 
 		 236 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  25.32 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  26.37 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  22.9 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  26.37 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.18 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.09 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  24.47 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  26.01 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.74 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.82 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  25.15 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  25.24 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  25.71 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  20.64 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.72 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  23.4 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  31.75 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  25.21 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  33.33 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  26.34 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  28.91 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.09 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25.85 
 
 		 335 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.22 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  24.84 
 
 		 318 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.68 
 
 		 362 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  33.06 
 
 		 508 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 		 308 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.21 
 
 		 501 aa  54.7  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  21.74 
 
 		 338 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  26.25 
 
 		 447 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  21.28 
 
 		 367 aa  53.9  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 		 460 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 		 460 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  24.07 
 
 		 320 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  28.82 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  25 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  25.52 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  27.46 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1029  putative site-specific DNA-methyltransferase  24.48 
 
 		 383 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  22.78 
 
 		 368 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  22.85 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  26.53 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  21.05 
 
 		 438 aa  52  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>