79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4299 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4299  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 467 aa  964    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0125  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.68 
 
 		 541 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1433  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.48 
 
 		 471 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2746  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.56 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4194  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.5 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.741265 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0340  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.52 
 
 		 473 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  24.05 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  25.58 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  22.8 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  21.16 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0058  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  24.14 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.192929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  23.26 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  26.79 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  24.27 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24.17 
 
 		 331 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  24.91 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0118  type II DNA-methyltransferase, putative  19.74 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.617459  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  21.53 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.61 
 
 		 727 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.38 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  21.67 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  23.77 
 
 		 423 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  26.78 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  26.78 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  26.78 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  26.78 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  23.77 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  26.78 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  24.09 
 
 		 657 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  22.9 
 
 		 327 aa  51.2  0.00004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  20.83 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 460 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 460 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  21.25 
 
 		 313 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  22.4 
 
 		 328 aa  50.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  28.17 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  22.29 
 
 		 318 aa  50.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  22.77 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  26.23 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  23.89 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  24.82 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  21.04 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  25.24 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.04 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  23.68 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  21.48 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  25.76 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.6 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  24.49 
 
 		 491 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  23.89 
 
 		 324 aa  47.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  20.96 
 
 		 417 aa  47.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 		 456 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.39 
 
 		 652 aa  47  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  21.43 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  22.99 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.13 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  22.22 
 
 		 317 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  24.1 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  24.1 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  24.1 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  21.95 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.92 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  24.1 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  22.3 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  23.19 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  24.1 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  25.71 
 
 		 671 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  21.93 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  22.43 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  22.84 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  22.51 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  19.74 
 
 		 311 aa  43.5  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  24.65 
 
 		 471 aa  43.1  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>