17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2374 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2369  C-5 cytosine-specific DNA methylase  61.85 
 
 		 596 aa  736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0658  C-5 cytosine-specific DNA methylase  54.69 
 
 		 648 aa  665    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.538294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2937  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.98 
 
 		 692 aa  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241378  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2352  C-5 cytosine-specific DNA methylase  57.61 
 
 		 559 aa  672    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1720  C-5 cytosine-specific DNA methylase  78.75 
 
 		 434 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000451649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1185  C-5 cytosine-specific DNA methylase  76.22 
 
 		 559 aa  699    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00256863  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2374  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 636 aa  1293    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0270809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1717  C-5 cytosine-specific DNA methylase  85.71 
 
 		 135 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1093  C-5 cytosine-specific DNA methylase  63.81 
 
 		 107 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00117815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1573  C-5 cytosine-specific DNA methylase  63.81 
 
 		 107 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00203711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2452  hypothetical protein  48.12 
 
 		 177 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000760235  unclonable  0.000000000305739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 		 371 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 		 374 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  26.52 
 
 		 373 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1433  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.53 
 
 		 471 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  24.46 
 
 		 358 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0125  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.21 
 
 		 541 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>