38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0658 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0658  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 648 aa  1345    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.538294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2937  C-5 cytosine-specific DNA methylase  50.58 
 
 		 692 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1185  C-5 cytosine-specific DNA methylase  51.31 
 
 		 559 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00256863  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2352  C-5 cytosine-specific DNA methylase  47.75 
 
 		 559 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2374  C-5 cytosine-specific DNA methylase  47.39 
 
 		 636 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0270809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2369  C-5 cytosine-specific DNA methylase  46.76 
 
 		 596 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1720  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.38 
 
 		 434 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000451649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1717  C-5 cytosine-specific DNA methylase  62.5 
 
 		 135 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2452  hypothetical protein  48.57 
 
 		 177 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000760235  unclonable  0.000000000305739 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1573  C-5 cytosine-specific DNA methylase  54.64 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00203711  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1093  C-5 cytosine-specific DNA methylase  54.64 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00117815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  26.21 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  24.68 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  21.22 
 
 		 345 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  23.17 
 
 		 371 aa  53.9  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  24.03 
 
 		 358 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  26.36 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 		 438 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  25.88 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 		 500 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  26.6 
 
 		 381 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.87 
 
 		 375 aa  50.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 434 aa  50.8  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  27.14 
 
 		 283 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  31.16 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.16 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 		 446 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 		 671 aa  48.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0012  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.43 
 
 		 333 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  23.57 
 
 		 366 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  23 
 
 		 344 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.85 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 		 320 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  23.59 
 
 		 399 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2746  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.93 
 
 		 463 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>