More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0729 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
344 aa  699    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
326 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
325 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
323 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.75 
 
 
325 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  30.52 
 
 
325 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.65 
 
 
333 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
327 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
325 aa  142  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.14 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
342 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.43 
 
 
338 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
330 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
327 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.53 
 
 
330 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.32 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  28.03 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.53 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.55 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  28.03 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.32 
 
 
331 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 
331 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  31.76 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
324 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.16 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
335 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  28.12 
 
 
422 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.48 
 
 
322 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.72 
 
 
322 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.62 
 
 
327 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 
325 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 
325 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.23 
 
 
325 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.12 
 
 
324 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
321 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
329 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001036  hypothetical protein  30 
 
 
330 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  26.57 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  27.39 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.81 
 
 
322 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1909  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  26.75 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  25.49 
 
 
329 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  26.75 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  26.54 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
196 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  24.92 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.25 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.33 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.01 
 
 
326 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  24.84 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00905  possible NADH oxidoreductase  29.02 
 
 
374 aa  89.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  25.25 
 
 
325 aa  89.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 
329 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  27.85 
 
 
372 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 
330 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39237  predicted protein  27.2 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34892  mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase 2  24.5 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537322  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.22 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1680  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.06 
 
 
320 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105299  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.57 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.33 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  26.58 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1766  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.37 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0377504  normal  0.772625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.61 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  25.49 
 
 
326 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.6 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.07 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21890  putative oxidoreductase  29.03 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1673  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  24.03 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1869  putative oxidoreductase  29.03 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.38 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.85 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  24.1 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.33 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  26.64 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.29 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.16 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.72 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.59 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  27.39 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3200  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.02 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1269  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.67 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731521  normal  0.0486073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.45 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  25.41 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>