More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4733 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
322 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  81.06 
 
 
322 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  41.37 
 
 
326 aa  262  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  34.15 
 
 
330 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.4 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.16 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.85 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
330 aa  178  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.85 
 
 
331 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
331 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
330 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  33.74 
 
 
330 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.33 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  36.4 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.02 
 
 
327 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
327 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
325 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.01 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1909  alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 
309 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001036  hypothetical protein  31.37 
 
 
330 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.52 
 
 
323 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.67 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  30.74 
 
 
331 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  26.71 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  27.08 
 
 
325 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.22 
 
 
324 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
319 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.85 
 
 
325 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
326 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
328 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.48 
 
 
344 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.61 
 
 
328 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.91 
 
 
331 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.79 
 
 
327 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  27.08 
 
 
328 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.15 
 
 
345 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 
330 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.88 
 
 
329 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.56 
 
 
328 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  26.56 
 
 
328 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  26.77 
 
 
328 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  26.77 
 
 
328 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  26.77 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  33.9 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.25 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  25.62 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.28 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
333 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  26.79 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  26.79 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  25.67 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.32 
 
 
324 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.22 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.98 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  27.36 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.44 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2841  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
325 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  27.9 
 
 
322 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  26.77 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.66 
 
 
324 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  29.96 
 
 
351 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
325 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
320 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
324 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
321 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.38 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.61 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.97 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  25.41 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.8 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2960  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.02 
 
 
367 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.53 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.72 
 
 
331 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 
340 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.01 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.62 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  33.48 
 
 
319 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.14 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.3 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 
321 aa  89.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  26.61 
 
 
325 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.84 
 
 
326 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>