More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4679 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
322 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  81.06 
 
 
322 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  40.72 
 
 
326 aa  255  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  40.19 
 
 
322 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.4 
 
 
324 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  35.85 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.02 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  36.02 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  35.47 
 
 
330 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.63 
 
 
331 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.63 
 
 
331 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
331 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.63 
 
 
330 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 
330 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
330 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.76 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
327 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
326 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001036  hypothetical protein  30.72 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.48 
 
 
323 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.33 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1909  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  29.28 
 
 
325 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.41 
 
 
331 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.05 
 
 
329 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
319 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.19 
 
 
325 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.79 
 
 
343 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.72 
 
 
344 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
328 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.56 
 
 
345 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
329 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.49 
 
 
329 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.46 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.7 
 
 
327 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  29.35 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  25.99 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 
329 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 
329 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 
322 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 
329 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  28.18 
 
 
340 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  25.57 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.57 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.49 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  30.07 
 
 
422 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  25.69 
 
 
328 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  25.69 
 
 
328 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.18 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  28.18 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.91 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
351 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.89 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 
333 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  30.82 
 
 
372 aa  92.4  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
342 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  28.53 
 
 
319 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6194  alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.8 
 
 
352 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.63 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.08 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.25 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 
322 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  25.23 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.48 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  26.44 
 
 
340 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 
319 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2841  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.05 
 
 
318 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  25.53 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.11 
 
 
310 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.8 
 
 
326 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.82 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.2 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.24 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2960  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.61 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.84 
 
 
340 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.53 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.84 
 
 
340 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.83 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.82 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1609  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.99 
 
 
318 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.203657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.55 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  26.42 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>