More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2862 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 
340 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  696    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  94.96 
 
 
340 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  97.65 
 
 
340 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  77.45 
 
 
340 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  76.85 
 
 
340 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  74.48 
 
 
340 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  60.36 
 
 
340 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  58.28 
 
 
339 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  57.99 
 
 
339 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  57.27 
 
 
340 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.324261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.73 
 
 
337 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
330 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.12 
 
 
329 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
329 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
328 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
329 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
329 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
329 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
329 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.94 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  33.13 
 
 
360 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  31.75 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.36 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.94 
 
 
329 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.14 
 
 
338 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  29.97 
 
 
337 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.34 
 
 
329 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.66 
 
 
326 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.87 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.67 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.33 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
353 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  28.13 
 
 
2500 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  30.09 
 
 
327 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  30.09 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  30.09 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  30.09 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  30.09 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  30.09 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.17 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  31.1 
 
 
2220 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6167  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.88 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224463  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 
329 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.06 
 
 
327 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 
329 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 
329 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  28.53 
 
 
389 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  29.75 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
326 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.25 
 
 
331 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
339 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.34 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.03 
 
 
322 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  27.99 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.82 
 
 
335 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1703  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.17 
 
 
324 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  30.15 
 
 
322 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.74 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  27.63 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  29.81 
 
 
2543 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
325 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  26.36 
 
 
2523 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.07 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.01 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.46 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0180  alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.089146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.76 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.91 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.79 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.57 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.17 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.25 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.44 
 
 
320 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
326 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.17 
 
 
324 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
324 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  27.54 
 
 
2507 aa  109  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  29.47 
 
 
2546 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  26.41 
 
 
2188 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>