More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1273 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  100 
 
 
360 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  88.45 
 
 
329 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  82.37 
 
 
329 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  56.53 
 
 
329 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  55.02 
 
 
329 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.02 
 
 
329 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  54.71 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  54.41 
 
 
330 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  53.5 
 
 
329 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.71 
 
 
329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  52.28 
 
 
328 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  54.41 
 
 
329 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.94 
 
 
329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.58 
 
 
329 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  51.21 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  45.62 
 
 
333 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.67 
 
 
332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  45.62 
 
 
337 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.02 
 
 
338 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.62 
 
 
337 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.51 
 
 
326 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.86 
 
 
326 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.61 
 
 
331 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  36.8 
 
 
339 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  36.5 
 
 
339 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.62 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  34.32 
 
 
340 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37.24 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.324261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.41 
 
 
340 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
340 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.13 
 
 
340 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
340 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
340 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.62 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
326 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
330 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.42 
 
 
326 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.29 
 
 
342 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.29 
 
 
342 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.94 
 
 
328 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
342 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
339 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.5 
 
 
342 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.74 
 
 
335 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  32.52 
 
 
324 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.03 
 
 
326 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.93 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
326 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
317 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
342 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.4 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
322 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.44 
 
 
326 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
324 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.71 
 
 
326 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.82 
 
 
328 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
328 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  32.84 
 
 
389 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
344 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.07 
 
 
337 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
325 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.79 
 
 
327 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
321 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.24 
 
 
317 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
331 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.33 
 
 
336 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  31.91 
 
 
325 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.83 
 
 
338 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
325 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.93 
 
 
332 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.23 
 
 
335 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.62 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.19 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.02 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.33 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3286  quinone oxidoreductase  30.46 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.635243  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.33 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3544  quinone oxidoreductase  30.46 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.752673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.71 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3501  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.46 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
327 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5173  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31 
 
 
329 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  31.08 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3256  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.15 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3549  alcohol dehydrogenase  49.26 
 
 
136 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.33 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
322 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
322 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  30.86 
 
 
327 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1516  quinone oxidoreductase  31.44 
 
 
324 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000615527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>