More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2454 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 330 aa  663    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.12 
 
 		 329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  67.17 
 
 		 329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.17 
 
 		 329 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  57.45 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  56.23 
 
 		 328 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  52.28 
 
 		 329 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  52.89 
 
 		 329 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  53.33 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.58 
 
 		 329 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  52.58 
 
 		 329 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.5 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  47.88 
 
 		 337 aa  318  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  51.21 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  48.64 
 
 		 329 aa  299  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.24 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.03 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.42 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 		 338 aa  252  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.82 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.79 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.91 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  34.32 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  33.13 
 
 		 339 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  32.54 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.3 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.83 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.72 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.324261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.84 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.92 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  32.25 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.65 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.41 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  34.02 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.63 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.94 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5173  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.23 
 
 		 329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.89 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  32.32 
 
 		 325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  31.71 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3286  quinone oxidoreductase  30.58 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.635243  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.33 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3544  quinone oxidoreductase  30.58 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.752673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3501  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.58 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3512  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.58 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.83 
 
 		 324 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.33 
 
 		 336 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  30.58 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3256  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.28 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.63 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.46 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3193  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.92 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.63 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.02 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.23 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  31.23 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  32.54 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.13 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  31.23 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  31.23 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  31.23 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.23 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  31.23 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.83 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.17 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  32.55 
 
 		 389 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3200  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  29.97 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>