More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3210 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
330 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  65.96 
 
 
329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  64.44 
 
 
329 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.44 
 
 
329 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  64.44 
 
 
329 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.35 
 
 
329 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.27 
 
 
329 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  55.32 
 
 
329 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.23 
 
 
329 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  54.41 
 
 
360 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  53.33 
 
 
330 aa  349  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  54.71 
 
 
329 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  53.37 
 
 
329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.98 
 
 
329 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  51.06 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 
333 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  46.34 
 
 
337 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.09 
 
 
338 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.43 
 
 
337 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.94 
 
 
332 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 
323 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.52 
 
 
326 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.39 
 
 
331 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.24 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  34.42 
 
 
339 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  34.42 
 
 
339 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.84 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  32.84 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
340 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
340 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.03 
 
 
340 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.324261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.13 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.66 
 
 
340 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3549  alcohol dehydrogenase  59.56 
 
 
136 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6434  alcohol dehydrogenase  75 
 
 
235 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.461094  normal  0.186304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.2 
 
 
326 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.85 
 
 
332 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
332 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
322 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5173  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.26 
 
 
329 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.31 
 
 
328 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.04 
 
 
325 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.54 
 
 
325 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
339 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
326 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.92 
 
 
334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
334 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
333 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.02 
 
 
328 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
342 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
339 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.84 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
333 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
329 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.28 
 
 
324 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.33 
 
 
336 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  33.13 
 
 
325 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
335 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.55 
 
 
327 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.28 
 
 
342 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  33.13 
 
 
325 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
332 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.92 
 
 
342 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.13 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.28 
 
 
333 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0411  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
329 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201425  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  34.04 
 
 
389 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.44 
 
 
639 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  33.43 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.01 
 
 
342 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.94 
 
 
324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.78 
 
 
336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.13 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  34.78 
 
 
336 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  32.32 
 
 
328 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
338 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  34.78 
 
 
336 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
328 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.13 
 
 
335 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 
353 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.86 
 
 
341 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  32.72 
 
 
328 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  32.72 
 
 
328 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3672  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
337 aa  143  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
332 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.71 
 
 
325 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.29 
 
 
334 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
325 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.43 
 
 
332 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
325 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.14 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>