More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6434 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6434  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.461094  normal  0.186304 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  79.81 
 
 
329 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  80.77 
 
 
329 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  79.81 
 
 
329 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  79.81 
 
 
329 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  75 
 
 
330 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  77.88 
 
 
329 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  55.77 
 
 
329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.62 
 
 
329 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  60.78 
 
 
329 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
329 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  55.77 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  58.25 
 
 
360 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.46 
 
 
338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.69 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.81 
 
 
329 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.92 
 
 
332 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  47.12 
 
 
328 aa  98.6  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  42.72 
 
 
337 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.19 
 
 
323 aa  91.7  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  49.53 
 
 
333 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.14 
 
 
337 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2667  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.78 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0742  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.34 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  42.72 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2955  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574608  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3039  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  37.86 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2977  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0293336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2827  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.83 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2862  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.89 
 
 
340 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823594  normal  0.0176642 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07194  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02090)  40 
 
 
336 aa  72  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362301  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  36.27 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.17 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.27 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.66 
 
 
3176 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.17 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0059  alcohol dehydrogenase  43.01 
 
 
325 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40.78 
 
 
327 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40.78 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40.78 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.84 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40.78 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  40.78 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.08 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.81 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.81 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0756  putative quinone oxidoreductase  39.81 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000103949  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.42 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.73 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.81 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  37.9 
 
 
327 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  37.9 
 
 
327 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  37.9 
 
 
327 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  37.9 
 
 
327 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.24 
 
 
326 aa  65.1  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0914  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.16 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
324 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84928  NADPH:quinone reductase  43.68 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.548816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2184  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
340 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.742883  normal  0.0144783 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  36.22 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.89 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  43 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  36.22 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  43 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  36.22 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
339 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.31 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.33 
 
 
325 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  31.38 
 
 
325 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  43.01 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  39.81 
 
 
327 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11941  oxidoreductase fadB5  35.77 
 
 
334 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  42 
 
 
325 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.27 
 
 
323 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
324 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.18 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
327 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
339 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.52 
 
 
328 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0255  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  36.07 
 
 
327 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.263787  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  37.1 
 
 
327 aa  62.4  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6167  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.62 
 
 
323 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224463  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  34.65 
 
 
325 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
332 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
326 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.76 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
324 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
324 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  42 
 
 
325 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
326 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>