More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3137 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.9 
 
 
317 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.3 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
308 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  43.67 
 
 
314 aa  241  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  42.54 
 
 
308 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.69 
 
 
332 aa  235  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.5 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.85 
 
 
319 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  42.54 
 
 
312 aa  232  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.2 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.54 
 
 
314 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.5 
 
 
332 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.5 
 
 
332 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
332 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.5 
 
 
332 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.61 
 
 
332 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.81 
 
 
313 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.91 
 
 
332 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  39.23 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
313 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
312 aa  219  6e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  40.06 
 
 
308 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.94 
 
 
317 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
317 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.84 
 
 
333 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.35 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
333 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.63 
 
 
639 aa  211  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
307 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
333 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  36.31 
 
 
317 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  38.98 
 
 
305 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  37.7 
 
 
323 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.31 
 
 
317 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.35 
 
 
333 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 
334 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
307 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  38.36 
 
 
315 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.53 
 
 
338 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.92 
 
 
314 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 
322 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  38.8 
 
 
325 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.85 
 
 
308 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
333 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.37 
 
 
314 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
337 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.94 
 
 
333 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.19 
 
 
329 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 
333 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 
333 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
339 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.03 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.12 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
334 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.33 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.64 
 
 
333 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  37.65 
 
 
331 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.5 
 
 
335 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
335 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
326 aa  198  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.34 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  37.05 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.65 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.49 
 
 
328 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.35 
 
 
331 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.68 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
348 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
321 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.35 
 
 
331 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.35 
 
 
333 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.3 
 
 
313 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.06 
 
 
307 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
308 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.24 
 
 
307 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  37.7 
 
 
317 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.91 
 
 
308 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.22 
 
 
310 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
320 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.13 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 
317 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
326 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.02 
 
 
315 aa  185  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.92 
 
 
287 aa  185  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.24 
 
 
314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.65 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.44 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.23 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  34.64 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.75 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.42 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>