More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0112 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
334 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  70.99 
 
 
333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.88 
 
 
333 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  70.78 
 
 
333 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  70.78 
 
 
333 aa  447  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  70.18 
 
 
333 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.17 
 
 
333 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.77 
 
 
333 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.36 
 
 
333 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.25 
 
 
333 aa  435  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.25 
 
 
333 aa  428  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  68.07 
 
 
333 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  63.25 
 
 
334 aa  418  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  57.83 
 
 
333 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.24 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  58.95 
 
 
333 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  59.94 
 
 
331 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  50 
 
 
332 aa  348  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.4 
 
 
332 aa  347  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  49.39 
 
 
332 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  49.1 
 
 
332 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.39 
 
 
332 aa  346  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
332 aa  346  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.8 
 
 
332 aa  345  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.4 
 
 
332 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  49.1 
 
 
332 aa  342  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 
339 aa  342  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  49.1 
 
 
333 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.85 
 
 
334 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.74 
 
 
287 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  51.51 
 
 
333 aa  329  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 
339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  47.89 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.91 
 
 
338 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 
348 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
337 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.69 
 
 
333 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.81 
 
 
317 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
317 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.92 
 
 
317 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  41.02 
 
 
308 aa  261  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  43.92 
 
 
317 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
333 aa  251  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
333 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  40.06 
 
 
308 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
313 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.04 
 
 
333 aa  226  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2686  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.64 
 
 
333 aa  225  8e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.65 
 
 
314 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  37.69 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
320 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  37.43 
 
 
323 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.97 
 
 
317 aa  205  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.69 
 
 
639 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.84 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.74 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.91 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.83 
 
 
314 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.24 
 
 
313 aa  196  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  34.13 
 
 
308 aa  195  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.3 
 
 
331 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  34.63 
 
 
305 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.61 
 
 
308 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.69 
 
 
323 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
326 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
310 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.01 
 
 
331 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  34.73 
 
 
304 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.62 
 
 
335 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
335 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
321 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  33.43 
 
 
331 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  33.43 
 
 
331 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4263  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.63 
 
 
342 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.43 
 
 
331 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.55 
 
 
307 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.44 
 
 
323 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.56 
 
 
313 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.98 
 
 
314 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1829  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.33 
 
 
312 aa  185  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000146701  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.26 
 
 
330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
317 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
322 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  33.43 
 
 
358 aa  181  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  38.44 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.12 
 
 
326 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.37 
 
 
328 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 
317 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.61 
 
 
319 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  35.57 
 
 
325 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.33 
 
 
313 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>