More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2461 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
319 aa  618  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  58.1 
 
 
325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.81 
 
 
326 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  55.8 
 
 
314 aa  322  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  56.01 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.19 
 
 
308 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.18 
 
 
310 aa  291  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  49.38 
 
 
315 aa  281  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.57 
 
 
313 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  52.38 
 
 
313 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  47.8 
 
 
312 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  46.39 
 
 
326 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  45.71 
 
 
308 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.06 
 
 
317 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.85 
 
 
310 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  43.26 
 
 
313 aa  238  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  45.77 
 
 
323 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.74 
 
 
329 aa  231  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.01 
 
 
314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  46.2 
 
 
317 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 
339 aa  222  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  40.38 
 
 
317 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.69 
 
 
317 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.38 
 
 
317 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  40.38 
 
 
317 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.56 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  41.9 
 
 
304 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.14 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.66 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  38.29 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.3 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.2 
 
 
328 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  41.32 
 
 
305 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  45.57 
 
 
307 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.88 
 
 
334 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  39.12 
 
 
308 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.68 
 
 
307 aa  202  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.02 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2330  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.61 
 
 
314 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700885  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.93 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.06 
 
 
339 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
308 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
320 aa  199  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.58 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.23 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.46 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.31 
 
 
333 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  36.59 
 
 
315 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.93 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 
337 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
333 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.05 
 
 
313 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.12 
 
 
338 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.33 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.06 
 
 
311 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.3 
 
 
639 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.63 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.81 
 
 
333 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.63 
 
 
332 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
333 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
332 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
332 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
332 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  39.88 
 
 
339 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
333 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.91 
 
 
333 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 
333 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  34.23 
 
 
333 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03489  quinone oxidoreductase  37.97 
 
 
316 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.23 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002527  NADPH:quinone reductase  38.29 
 
 
316 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.37 
 
 
343 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.69 
 
 
333 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
328 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.95 
 
 
334 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  41.24 
 
 
307 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
333 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.59 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4293  NADPH:quinone reductase  43.17 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213277  normal  0.0250565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.96 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.94 
 
 
334 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.2 
 
 
334 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
333 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.91 
 
 
333 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4346  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.6 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0220735  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.93 
 
 
333 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
333 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.05 
 
 
334 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0087  quinone oxidoreductase  37.3 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
339 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>