More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1862 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  100 
 
 		 333 aa  663    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  81.08 
 
 		 333 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  76.28 
 
 		 333 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  75.38 
 
 		 348 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  72.97 
 
 		 333 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.99 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  71.99 
 
 		 337 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.97 
 
 		 334 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  66.67 
 
 		 339 aa  457  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  65.47 
 
 		 339 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.65 
 
 		 332 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.95 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.75 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.05 
 
 		 332 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.05 
 
 		 332 aa  332  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  51.05 
 
 		 332 aa  330  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.75 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  50.75 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  50.75 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.15 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.45 
 
 		 332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.65 
 
 		 333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  52.55 
 
 		 333 aa  325  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.1 
 
 		 334 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.65 
 
 		 333 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.55 
 
 		 333 aa  321  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.55 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.25 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.75 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  51.65 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  47.45 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  44.58 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.92 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  41.92 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  41.62 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.32 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.4 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  37.39 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.87 
 
 		 639 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.14 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.69 
 
 		 308 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2686  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.73 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  35.54 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.34 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  35.44 
 
 		 304 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.35 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.24 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 		 325 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  32.94 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  32.94 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  34.23 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.73 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.36 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.65 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.28 
 
 		 335 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 335 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.13 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.24 
 
 		 313 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.73 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  31.83 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.49 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.23 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.5 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.4 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.63 
 
 		 319 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.61 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.87 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.31 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.82 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  33.53 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.63 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.07 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 		 339 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  31.96 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.44 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.83 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.4 
 
 		 337 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>